変換後、出力先フォルダには以下のファイルが生成されます:

setting.xml をインターネット ブラウザで表示すると、以下のように表示されます:

テキスト エディタで setting.xml を開き、以下の行が含まれているのを確認します:
<aXmag information= "aXmag PDF to Flash page flipping
magazine"><pagewidth>400</pagewidth>
<pageheight>600</pageheight><pagecount>2</pagecount><pagedir>Files</pagedir><logo>axmag</logo>
<flipsound>[default]</flipsound><bgsound></bgsound><righttoleft>0</righttoleft><hidesew>0</hidesew>
<print>1</print><ad_title>axmag
publication</ad_title><ad_author>aXmag</ad_author><thumbnails>1</thumbnails>
<readmode>0</readmode><sharebutton>1</sharebutton><controlbar>1</controlbar><aboutbutton>0</aboutbutton>
<logourl></logourl></aXmag>
最後の </aXmag> タグの前に、以下のタグを追加します。<pdfurl> タグには、PDF が保存されているパスを指定します:
<downloadpdf>1</downloadpdf><pdfurl>http://www.axmag.com/download/UserGuide.pdf</pdfurl>
settings.xml は以下のようになります:

setting.xml に変更を反映して index.html を開くと、ナビゲーション ツールバーに [Download PDF]
ボタンが追加されています:

なお、ローカル環境では、デフォルトの状態ではリンクは機能しません。
リンクを有効化する方法については、こちらのページ
を参照してください。