クラスターにおける結果の最適化

クラスターのベンチマークを行うには、以下の手順に従ってください (一部の手順はオプションです)。ステップ 3 と 4 の繰り返しには特に注意してください。 クラスターのパフォーマンスを最大限に引き出せる HPL パラメーター (HPL.dat で指定) の検索が繰り返されます。

1. HPL をインストールして、HPL がすべてのノードで機能していることを確認します。

2. (オプション) ディストリビューションに含まれている nodeperf.c を実行し、すべてのノードで DGEMM のパフォーマンスを確認します。

   MPI およびインテル® マス・カーネル・ライブラリー (インテル® MKL) を使用して nodeperf.c をコンパイルします。 次に例を示します。

   mpiicc -O3 nodeperf.c -openmp -Wl,--start-group \ 
   $MKLPATH/libmkl_intel_lp64.a $MKLPATH/libmkl_intel_thread.a \ 
   $MKLPATH/libmkl_core.a -Wl,--end-group -lpthread –o nodeperf
                   
                   

   すべてのノードで nodeperf を起動することは、非常に大規模なクラスターでは特に有用です。nodeperf を使用すると、悪いノードを見つけるためにクラスターでさまざまな小さな Intel® Optimized MP LINPACK Benchmark 実行を行うことなく、潜在的な問題のスポットを素早く識別することができます。 検索はすべてのノードに対して 1 つずつ行われ、DGEMM のパフォーマンスに続けてホスト識別子が報告されます。 このため、DGEMM のパフォーマンスが高いほど、ノードの実行が高速であったことになります。

3. 使用するクラスターに合わせて HPL.dat を編集します。
   詳細は、HPL のドキュメントを参照してください。 ただし、少なくとも 4 つのノードを使用するようにしてください。

4. -DASYOUGO、-DASYOUGO2 または -DENDEARLY などのコンパイラー・オプションを使用して HPL を実行します。 これらのオプションを使用することで、パフォーマンスに対する考察が、HPL から通常得られるよりも早く得ることができます。

   実行するときは、以下の推奨事項に従ってください。

   • 検索時間を短縮するため、Intel® Optimized MP LINPACK Benchmark (HPL のパッチ済みバージョン) を使用してください。

     Intel® Optimized MP LINPACK Benchmark では、パフォーマンスに影響を与える可能性のある機能はすべてオプションです。このため、検索時間を短縮する新しいオプションを使用しない場合、これらの機能は無効になります。拡張の主な目的は、ソリューションを見つけるための支援です。

     HPL では、多くの異なるパラメーターの検索に長い時間がかかりますが、Intel® Optimized MP LINPACK Benchmark では、最適な数を得ることを目標にしています。

     入力が固定でない場合、大きなパラメーター空間を検索する必要があります。あらゆる入力の全数検索は、強力なクラスターでもかなりの時間がかかります。Intel®Optimized MP LINPACK Benchmark は、オプションで実行中のパフォーマンスの情報を出力します。早く終了することもできます。

   • -DENDEARLY-DASYOUGO2 を使用してコンパイルし、負のしきい値を使用して時間を短縮できます (TOP 500 に提出する最終的な実行で負のしきい値を使用しないでください)。 HPL 2.1 入力ファイル HPL.dat の 13 行でしきい値を設定することができます。

   • 問題の完了まで実行する場合は、-DASYOUGO を使用してください。

5. 迅速なパフォーマンス・フィードバックを使用し、最良のパフォーマンスが得られるまでステップ 3 と 4 を繰り返します。